De bodembedekking in natuurlijke terrariums heeft meerdere functies, en dient niet enkel als decoratie. Zij speelt een erg belangrijke rol in het bepalen van het microklimaat van het terrarium. Gravende en zich ingravende reptielen en amfibieën hebben andere behoeften dan boombewonende soorten, terwijl woestijndieren dan weer een heel andere bodembedekking vereisen. Warmtegeleiding is belangrijk als een bodemverwarmer zoals de Heat Wave wordt gebruikt en de vochtopname zal bijdragen tot de luchtvochtigheid. Exo Terra ontwikkelde een gamma bodemsubstraten voor zowel de droge, vochtige als aqua-terrariums, alle uit natuurlijk materiaal.